Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA4P12838 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA4P12838 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEFA4P12838 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEFA4P12838 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA4P12838 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA4P12838 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA4P12838 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA4P12838 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA4P12838 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms