Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RGPD1P0DJD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RGPD1P0DJD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RGPD1P0DJD0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RGPD1P0DJD0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RGPD1P0DJD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RGPD1P0DJD0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
RGPD1P0DJD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RGPD1P0DJD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RGPD1P0DJD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RGPD1P0DJD0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RGPD1P0DJD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RGPD1P0DJD0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RGPD1P0DJD0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RGPD1P0DJD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
RGPD1P0DJD0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RGPD1P0DJD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RGPD1P0DJD0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD1P0DJD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RGPD1P0DJD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RGPD1P0DJD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RGPD1P0DJD0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RGPD1P0DJD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RGPD1P0DJD0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RGPD1P0DJD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RGPD1P0DJD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
RGPD1P0DJD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RGPD1P0DJD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms