Protein–RNA interactions for Protein: P08887

IL6R, Interleukin-6 receptor subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6RP08887 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL6RP08887 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL6RP08887 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IL6RP08887 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IL6RP08887 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IL6RP08887 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IL6RP08887 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IL6RP08887 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL6RP08887 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL6RP08887 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IL6RP08887 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL6RP08887 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IL6RP08887 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL6RP08887 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IL6RP08887 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL6RP08887 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL6RP08887 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IL6RP08887 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL6RP08887 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IL6RP08887 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IL6RP08887 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL6RP08887 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL6RP08887 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IL6RP08887 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL6RP08887 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL6RP08887 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL6RP08887 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL6RP08887 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IL6RP08887 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL6RP08887 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL6RP08887 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL6RP08887 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL6RP08887 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL6RP08887 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL6RP08887 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL6RP08887 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL6RP08887 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL6RP08887 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL6RP08887 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL6RP08887 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL6RP08887 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL6RP08887 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL6RP08887 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL6RP08887 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IL6RP08887 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IL6RP08887 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL6RP08887 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL6RP08887 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL6RP08887 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL6RP08887 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL6RP08887 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL6RP08887 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL6RP08887 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL6RP08887 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL6RP08887 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IL6RP08887 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IL6RP08887 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL6RP08887 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IL6RP08887 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL6RP08887 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IL6RP08887 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL6RP08887 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL6RP08887 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL6RP08887 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IL6RP08887 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IL6RP08887 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IL6RP08887 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL6RP08887 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL6RP08887 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IL6RP08887 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IL6RP08887 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL6RP08887 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL6RP08887 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL6RP08887 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL6RP08887 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL6RP08887 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL6RP08887 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL6RP08887 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL6RP08887 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL6RP08887 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IL6RP08887 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL6RP08887 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL6RP08887 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL6RP08887 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IL6RP08887 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL6RP08887 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL6RP08887 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL6RP08887 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL6RP08887 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL6RP08887 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL6RP08887 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL6RP08887 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL6RP08887 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL6RP08887 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IL6RP08887 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL6RP08887 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL6RP08887 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IL6RP08887 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IL6RP08887 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IL6RP08887 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms