Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NGFRP08138 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NGFRP08138 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NGFRP08138 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NGFRP08138 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NGFRP08138 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NGFRP08138 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NGFRP08138 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NGFRP08138 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGFRP08138 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGFRP08138 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGFRP08138 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGFRP08138 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGFRP08138 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NGFRP08138 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NGFRP08138 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGFRP08138 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGFRP08138 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGFRP08138 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGFRP08138 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGFRP08138 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NGFRP08138 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NGFRP08138 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NGFRP08138 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NGFRP08138 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NGFRP08138 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NGFRP08138 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGFRP08138 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NGFRP08138 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGFRP08138 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGFRP08138 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGFRP08138 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGFRP08138 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGFRP08138 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGFRP08138 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGFRP08138 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGFRP08138 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGFRP08138 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGFRP08138 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGFRP08138 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGFRP08138 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGFRP08138 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGFRP08138 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGFRP08138 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGFRP08138 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGFRP08138 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGFRP08138 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGFRP08138 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGFRP08138 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGFRP08138 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGFRP08138 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGFRP08138 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGFRP08138 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGFRP08138 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGFRP08138 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGFRP08138 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGFRP08138 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NGFRP08138 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NGFRP08138 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NGFRP08138 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NGFRP08138 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NGFRP08138 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NGFRP08138 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NGFRP08138 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NGFRP08138 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NGFRP08138 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NGFRP08138 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGFRP08138 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NGFRP08138 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGFRP08138 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NGFRP08138 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NGFRP08138 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGFRP08138 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NGFRP08138 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NGFRP08138 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGFRP08138 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGFRP08138 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGFRP08138 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NGFRP08138 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NGFRP08138 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGFRP08138 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NGFRP08138 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NGFRP08138 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGFRP08138 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGFRP08138 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGFRP08138 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGFRP08138 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGFRP08138 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGFRP08138 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGFRP08138 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGFRP08138 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGFRP08138 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGFRP08138 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGFRP08138 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGFRP08138 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGFRP08138 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NGFRP08138 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGFRP08138 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGFRP08138 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGFRP08138 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms