Protein–RNA interactions for Protein: P07478

PRSS2, Trypsin-2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS2P07478 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRSS2P07478 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRSS2P07478 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRSS2P07478 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRSS2P07478 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRSS2P07478 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRSS2P07478 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRSS2P07478 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRSS2P07478 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms