Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV1-33P01594 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGKV1-33P01594 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV1-33P01594 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV1-33P01594 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IGKV1-33P01594 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-33P01594 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-33P01594 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-33P01594 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-33P01594 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-33P01594 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms