Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GASTP01350 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GASTP01350 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GASTP01350 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GASTP01350 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GASTP01350 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GASTP01350 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GASTP01350 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GASTP01350 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GASTP01350 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GASTP01350 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GASTP01350 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GASTP01350 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GASTP01350 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GASTP01350 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GASTP01350 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GASTP01350 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GASTP01350 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GASTP01350 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GASTP01350 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GASTP01350 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GASTP01350 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GASTP01350 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GASTP01350 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GASTP01350 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GASTP01350 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GASTP01350 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GASTP01350 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GASTP01350 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GASTP01350 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GASTP01350 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GASTP01350 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GASTP01350 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GASTP01350 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GASTP01350 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GASTP01350 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GASTP01350 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GASTP01350 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GASTP01350 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GASTP01350 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GASTP01350 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GASTP01350 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GASTP01350 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GASTP01350 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GASTP01350 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GASTP01350 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GASTP01350 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GASTP01350 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GASTP01350 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GASTP01350 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GASTP01350 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GASTP01350 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GASTP01350 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GASTP01350 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GASTP01350 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GASTP01350 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GASTP01350 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GASTP01350 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GASTP01350 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GASTP01350 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GASTP01350 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GASTP01350 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GASTP01350 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GASTP01350 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GASTP01350 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GASTP01350 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GASTP01350 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GASTP01350 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GASTP01350 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GASTP01350 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GASTP01350 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GASTP01350 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GASTP01350 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GASTP01350 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GASTP01350 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GASTP01350 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GASTP01350 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GASTP01350 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GASTP01350 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GASTP01350 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GASTP01350 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GASTP01350 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GASTP01350 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GASTP01350 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GASTP01350 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GASTP01350 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GASTP01350 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GASTP01350 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GASTP01350 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GASTP01350 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GASTP01350 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GASTP01350 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GASTP01350 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GASTP01350 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GASTP01350 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GASTP01350 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GASTP01350 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GASTP01350 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GASTP01350 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GASTP01350 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms