Protein–RNA interactions for Protein: O95969

SCGB1D2, Secretoglobin family 1D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D2O95969 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCGB1D2O95969 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCGB1D2O95969 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCGB1D2O95969 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCGB1D2O95969 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCGB1D2O95969 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCGB1D2O95969 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCGB1D2O95969 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCGB1D2O95969 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGB1D2O95969 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGB1D2O95969 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms