Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCBTB2O95199 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCBTB2O95199 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCBTB2O95199 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCBTB2O95199 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCBTB2O95199 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCBTB2O95199 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCBTB2O95199 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCBTB2O95199 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCBTB2O95199 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCBTB2O95199 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCBTB2O95199 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RCBTB2O95199 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCBTB2O95199 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCBTB2O95199 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCBTB2O95199 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCBTB2O95199 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCBTB2O95199 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCBTB2O95199 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCBTB2O95199 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms