Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC24DO94855 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC24DO94855 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC24DO94855 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEC24DO94855 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24DO94855 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24DO94855 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24DO94855 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC24DO94855 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24DO94855 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24DO94855 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms