Protein–RNA interactions for Protein: O75694

NUP155, Nuclear pore complex protein Nup155, humanhuman

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP155O75694 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
NUP155O75694 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NUP155O75694 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NUP155O75694 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NUP155O75694 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
NUP155O75694 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NUP155O75694 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
NUP155O75694 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NUP155O75694 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NUP155O75694 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
NUP155O75694 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NUP155O75694 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NUP155O75694 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NUP155O75694 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NUP155O75694 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NUP155O75694 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
NUP155O75694 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NUP155O75694 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
NUP155O75694 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NUP155O75694 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
NUP155O75694 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NUP155O75694 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NUP155O75694 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NUP155O75694 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NUP155O75694 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP155O75694 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP155O75694 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
NUP155O75694 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NUP155O75694 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP155O75694 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NUP155O75694 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP155O75694 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NUP155O75694 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NUP155O75694 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NUP155O75694 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NUP155O75694 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NUP155O75694 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NUP155O75694 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NUP155O75694 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP155O75694 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP155O75694 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
NUP155O75694 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NUP155O75694 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP155O75694 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP155O75694 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP155O75694 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NUP155O75694 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP155O75694 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
NUP155O75694 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NUP155O75694 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NUP155O75694 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NUP155O75694 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NUP155O75694 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NUP155O75694 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NUP155O75694 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NUP155O75694 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NUP155O75694 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NUP155O75694 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NUP155O75694 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NUP155O75694 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP155O75694 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP155O75694 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP155O75694 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NUP155O75694 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NUP155O75694 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NUP155O75694 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NUP155O75694 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NUP155O75694 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NUP155O75694 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NUP155O75694 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NUP155O75694 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NUP155O75694 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NUP155O75694 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NUP155O75694 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NUP155O75694 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NUP155O75694 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NUP155O75694 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NUP155O75694 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NUP155O75694 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NUP155O75694 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
NUP155O75694 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP155O75694 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP155O75694 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP155O75694 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP155O75694 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP155O75694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
NUP155O75694 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NUP155O75694 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUP155O75694 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUP155O75694 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
NUP155O75694 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP155O75694 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP155O75694 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP155O75694 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP155O75694 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP155O75694 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP155O75694 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
NUP155O75694 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP155O75694 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
NUP155O75694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms