Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PPFIA4O75335 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PPFIA4O75335 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPFIA4O75335 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPFIA4O75335 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPFIA4O75335 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPFIA4O75335 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PPFIA4O75335 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPFIA4O75335 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPFIA4O75335 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPFIA4O75335 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPFIA4O75335 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPFIA4O75335 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPFIA4O75335 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPFIA4O75335 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PPFIA4O75335 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PPFIA4O75335 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms