Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP12O75317 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP12O75317 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP12O75317 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP12O75317 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP12O75317 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP12O75317 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP12O75317 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP12O75317 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP12O75317 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP12O75317 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP12O75317 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP12O75317 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP12O75317 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
USP12O75317 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP12O75317 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP12O75317 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP12O75317 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP12O75317 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP12O75317 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP12O75317 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP12O75317 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP12O75317 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP12O75317 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP12O75317 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP12O75317 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP12O75317 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP12O75317 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP12O75317 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP12O75317 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP12O75317 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP12O75317 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP12O75317 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP12O75317 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP12O75317 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP12O75317 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP12O75317 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP12O75317 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP12O75317 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP12O75317 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP12O75317 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP12O75317 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP12O75317 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP12O75317 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP12O75317 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP12O75317 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP12O75317 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP12O75317 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP12O75317 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP12O75317 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP12O75317 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP12O75317 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP12O75317 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP12O75317 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP12O75317 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP12O75317 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP12O75317 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP12O75317 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP12O75317 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP12O75317 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP12O75317 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP12O75317 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP12O75317 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP12O75317 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP12O75317 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP12O75317 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP12O75317 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP12O75317 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP12O75317 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP12O75317 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP12O75317 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP12O75317 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP12O75317 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP12O75317 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP12O75317 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP12O75317 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP12O75317 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP12O75317 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP12O75317 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP12O75317 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP12O75317 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP12O75317 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP12O75317 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP12O75317 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP12O75317 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP12O75317 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP12O75317 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP12O75317 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP12O75317 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP12O75317 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP12O75317 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP12O75317 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP12O75317 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP12O75317 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP12O75317 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP12O75317 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP12O75317 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP12O75317 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP12O75317 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP12O75317 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.1 ms