Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
BRD4O60885 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
BRD4O60885 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
BRD4O60885 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
BRD4O60885 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
BRD4O60885 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
BRD4O60885 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
BRD4O60885 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
BRD4O60885 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
BRD4O60885 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
BRD4O60885 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
BRD4O60885 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
BRD4O60885 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
BRD4O60885 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
BRD4O60885 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
BRD4O60885 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BRD4O60885 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BRD4O60885 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BRD4O60885 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
BRD4O60885 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
BRD4O60885 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.78
BRD4O60885 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
BRD4O60885 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
BRD4O60885 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
BRD4O60885 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
BRD4O60885 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
BRD4O60885 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
BRD4O60885 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
BRD4O60885 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
BRD4O60885 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
BRD4O60885 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
BRD4O60885 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
BRD4O60885 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BRD4O60885 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BRD4O60885 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BRD4O60885 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
BRD4O60885 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
BRD4O60885 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
BRD4O60885 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
BRD4O60885 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
BRD4O60885 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
BRD4O60885 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
BRD4O60885 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
BRD4O60885 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BRD4O60885 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
BRD4O60885 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BRD4O60885 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BRD4O60885 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
BRD4O60885 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
BRD4O60885 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
BRD4O60885 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
BRD4O60885 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
BRD4O60885 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BRD4O60885 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BRD4O60885 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BRD4O60885 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BRD4O60885 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
BRD4O60885 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BRD4O60885 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BRD4O60885 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
BRD4O60885 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BRD4O60885 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BRD4O60885 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
BRD4O60885 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BRD4O60885 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BRD4O60885 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BRD4O60885 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BRD4O60885 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BRD4O60885 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BRD4O60885 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BRD4O60885 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BRD4O60885 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BRD4O60885 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
BRD4O60885 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BRD4O60885 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
BRD4O60885 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
BRD4O60885 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
BRD4O60885 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BRD4O60885 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BRD4O60885 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BRD4O60885 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BRD4O60885 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
BRD4O60885 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BRD4O60885 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BRD4O60885 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BRD4O60885 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BRD4O60885 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BRD4O60885 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BRD4O60885 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BRD4O60885 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BRD4O60885 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
BRD4O60885 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BRD4O60885 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
BRD4O60885 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
BRD4O60885 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BRD4O60885 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BRD4O60885 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
BRD4O60885 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
BRD4O60885 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
BRD4O60885 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms