Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PLIN1O60240 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PLIN1O60240 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PLIN1O60240 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PLIN1O60240 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PLIN1O60240 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PLIN1O60240 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PLIN1O60240 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PLIN1O60240 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLIN1O60240 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PLIN1O60240 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PLIN1O60240 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PLIN1O60240 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PLIN1O60240 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PLIN1O60240 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PLIN1O60240 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PLIN1O60240 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PLIN1O60240 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PLIN1O60240 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PLIN1O60240 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PLIN1O60240 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PLIN1O60240 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms