Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PLIN1O60240 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PLIN1O60240 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
PLIN1O60240 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
PLIN1O60240 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
PLIN1O60240 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PLIN1O60240 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PLIN1O60240 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
PLIN1O60240 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PLIN1O60240 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PLIN1O60240 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PLIN1O60240 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PLIN1O60240 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PLIN1O60240 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PLIN1O60240 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PLIN1O60240 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PLIN1O60240 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PLIN1O60240 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PLIN1O60240 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PLIN1O60240 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PLIN1O60240 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PLIN1O60240 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PLIN1O60240 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PLIN1O60240 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PLIN1O60240 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PLIN1O60240 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PLIN1O60240 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PLIN1O60240 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PLIN1O60240 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PLIN1O60240 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PLIN1O60240 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PLIN1O60240 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PLIN1O60240 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PLIN1O60240 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PLIN1O60240 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
PLIN1O60240 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PLIN1O60240 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PLIN1O60240 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PLIN1O60240 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PLIN1O60240 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PLIN1O60240 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PLIN1O60240 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PLIN1O60240 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PLIN1O60240 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PLIN1O60240 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PLIN1O60240 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PLIN1O60240 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PLIN1O60240 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PLIN1O60240 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PLIN1O60240 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PLIN1O60240 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PLIN1O60240 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PLIN1O60240 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PLIN1O60240 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PLIN1O60240 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PLIN1O60240 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PLIN1O60240 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PLIN1O60240 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PLIN1O60240 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PLIN1O60240 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PLIN1O60240 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PLIN1O60240 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PLIN1O60240 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PLIN1O60240 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PLIN1O60240 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PLIN1O60240 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PLIN1O60240 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PLIN1O60240 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLIN1O60240 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PLIN1O60240 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PLIN1O60240 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PLIN1O60240 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PLIN1O60240 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PLIN1O60240 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PLIN1O60240 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PLIN1O60240 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PLIN1O60240 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PLIN1O60240 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLIN1O60240 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PLIN1O60240 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PLIN1O60240 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PLIN1O60240 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PLIN1O60240 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PLIN1O60240 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PLIN1O60240 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PLIN1O60240 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLIN1O60240 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PLIN1O60240 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PLIN1O60240 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PLIN1O60240 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PLIN1O60240 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PLIN1O60240 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PLIN1O60240 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PLIN1O60240 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PLIN1O60240 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PLIN1O60240 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
PLIN1O60240 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLIN1O60240 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PLIN1O60240 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PLIN1O60240 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms