Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRTM2O43300 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM2O43300 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM2O43300 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM2O43300 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRTM2O43300 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRTM2O43300 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM2O43300 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRTM2O43300 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRTM2O43300 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRTM2O43300 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRTM2O43300 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRTM2O43300 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRTM2O43300 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRTM2O43300 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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