Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MAP3K13O43283 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K13O43283 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K13O43283 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MAP3K13O43283 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K13O43283 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MAP3K13O43283 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MAP3K13O43283 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K13O43283 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K13O43283 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K13O43283 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP3K13O43283 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP3K13O43283 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAP3K13O43283 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAP3K13O43283 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K13O43283 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAP3K13O43283 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K13O43283 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAP3K13O43283 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAP3K13O43283 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms