Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MEFVO15553 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MEFVO15553 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MEFVO15553 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MEFVO15553 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEFVO15553 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEFVO15553 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEFVO15553 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MEFVO15553 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MEFVO15553 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MEFVO15553 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MEFVO15553 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MEFVO15553 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MEFVO15553 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEFVO15553 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MEFVO15553 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MEFVO15553 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MEFVO15553 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MEFVO15553 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MEFVO15553 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEFVO15553 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MEFVO15553 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MEFVO15553 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MEFVO15553 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MEFVO15553 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEFVO15553 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MEFVO15553 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MEFVO15553 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEFVO15553 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MEFVO15553 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MEFVO15553 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEFVO15553 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MEFVO15553 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEFVO15553 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MEFVO15553 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEFVO15553 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MEFVO15553 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEFVO15553 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEFVO15553 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEFVO15553 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MEFVO15553 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEFVO15553 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MEFVO15553 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MEFVO15553 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MEFVO15553 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEFVO15553 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MEFVO15553 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MEFVO15553 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEFVO15553 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MEFVO15553 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MEFVO15553 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MEFVO15553 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MEFVO15553 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MEFVO15553 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MEFVO15553 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MEFVO15553 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEFVO15553 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MEFVO15553 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEFVO15553 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEFVO15553 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MEFVO15553 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MEFVO15553 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MEFVO15553 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MEFVO15553 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEFVO15553 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEFVO15553 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEFVO15553 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEFVO15553 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEFVO15553 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEFVO15553 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEFVO15553 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEFVO15553 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEFVO15553 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEFVO15553 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEFVO15553 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEFVO15553 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MEFVO15553 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEFVO15553 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEFVO15553 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEFVO15553 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEFVO15553 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEFVO15553 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEFVO15553 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEFVO15553 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEFVO15553 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEFVO15553 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEFVO15553 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEFVO15553 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEFVO15553 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEFVO15553 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEFVO15553 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEFVO15553 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEFVO15553 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEFVO15553 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MEFVO15553 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MEFVO15553 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MEFVO15553 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MEFVO15553 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEFVO15553 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MEFVO15553 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms