Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms