Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA5O15230 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA5O15230 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA5O15230 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA5O15230 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA5O15230 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA5O15230 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMA5O15230 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAMA5O15230 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LAMA5O15230 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMA5O15230 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA5O15230 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA5O15230 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA5O15230 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA5O15230 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA5O15230 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA5O15230 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA5O15230 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA5O15230 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA5O15230 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA5O15230 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms