Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD9O15198 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD9O15198 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMAD9O15198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMAD9O15198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD9O15198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD9O15198 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD9O15198 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD9O15198 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD9O15198 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms