Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WNT9AO14904 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WNT9AO14904 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WNT9AO14904 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WNT9AO14904 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WNT9AO14904 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WNT9AO14904 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WNT9AO14904 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WNT9AO14904 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WNT9AO14904 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WNT9AO14904 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WNT9AO14904 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WNT9AO14904 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WNT9AO14904 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WNT9AO14904 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
WNT9AO14904 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
WNT9AO14904 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WNT9AO14904 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WNT9AO14904 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WNT9AO14904 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WNT9AO14904 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
WNT9AO14904 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
WNT9AO14904 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WNT9AO14904 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WNT9AO14904 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WNT9AO14904 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WNT9AO14904 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
WNT9AO14904 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WNT9AO14904 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WNT9AO14904 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms