Protein–RNA interactions for Protein: O14796

SH2D1B, SH2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D1BO14796 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D1BO14796 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH2D1BO14796 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D1BO14796 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2D1BO14796 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D1BO14796 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D1BO14796 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D1BO14796 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2D1BO14796 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2D1BO14796 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms