Protein–RNA interactions for Protein: O14613

CDC42EP2, Cdc42 effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP2O14613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP2O14613 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP2O14613 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP2O14613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP2O14613 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP2O14613 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP2O14613 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP2O14613 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC42EP2O14613 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC42EP2O14613 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP2O14613 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP2O14613 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42EP2O14613 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42EP2O14613 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP2O14613 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP2O14613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42EP2O14613 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms