Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TXNDC9O14530 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXNDC9O14530 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXNDC9O14530 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXNDC9O14530 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TXNDC9O14530 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNDC9O14530 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC9O14530 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC9O14530 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNDC9O14530 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TXNDC9O14530 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC9O14530 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TXNDC9O14530 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms