Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms