Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN34H7C241 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN34H7C241 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN34H7C241 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN34H7C241 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN34H7C241 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN34H7C241 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN34H7C241 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN34H7C241 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms