Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYNX1G3V0Z9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYNX1G3V0Z9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYNX1G3V0Z9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYNX1G3V0Z9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LYNX1G3V0Z9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYNX1G3V0Z9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYNX1G3V0Z9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYNX1G3V0Z9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LYNX1G3V0Z9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LYNX1G3V0Z9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYNX1G3V0Z9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYNX1G3V0Z9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms