Protein–RNA interactions for Protein: G3V0Z9

LYNX1, HCG2043033, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1G3V0Z9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LYNX1G3V0Z9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LYNX1G3V0Z9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LYNX1G3V0Z9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LYNX1G3V0Z9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LYNX1G3V0Z9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LYNX1G3V0Z9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LYNX1G3V0Z9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LYNX1G3V0Z9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LYNX1G3V0Z9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LYNX1G3V0Z9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYNX1G3V0Z9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYNX1G3V0Z9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYNX1G3V0Z9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LYNX1G3V0Z9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYNX1G3V0Z9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LYNX1G3V0Z9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYNX1G3V0Z9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYNX1G3V0Z9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYNX1G3V0Z9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LYNX1G3V0Z9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LYNX1G3V0Z9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LYNX1G3V0Z9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LYNX1G3V0Z9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LYNX1G3V0Z9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYNX1G3V0Z9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LYNX1G3V0Z9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYNX1G3V0Z9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LYNX1G3V0Z9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LYNX1G3V0Z9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LYNX1G3V0Z9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LYNX1G3V0Z9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LYNX1G3V0Z9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LYNX1G3V0Z9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LYNX1G3V0Z9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LYNX1G3V0Z9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LYNX1G3V0Z9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LYNX1G3V0Z9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LYNX1G3V0Z9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LYNX1G3V0Z9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LYNX1G3V0Z9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LYNX1G3V0Z9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LYNX1G3V0Z9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LYNX1G3V0Z9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LYNX1G3V0Z9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LYNX1G3V0Z9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LYNX1G3V0Z9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LYNX1G3V0Z9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LYNX1G3V0Z9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LYNX1G3V0Z9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LYNX1G3V0Z9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LYNX1G3V0Z9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYNX1G3V0Z9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LYNX1G3V0Z9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LYNX1G3V0Z9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LYNX1G3V0Z9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYNX1G3V0Z9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYNX1G3V0Z9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYNX1G3V0Z9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LYNX1G3V0Z9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LYNX1G3V0Z9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LYNX1G3V0Z9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LYNX1G3V0Z9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYNX1G3V0Z9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LYNX1G3V0Z9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYNX1G3V0Z9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYNX1G3V0Z9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LYNX1G3V0Z9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYNX1G3V0Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYNX1G3V0Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYNX1G3V0Z9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LYNX1G3V0Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LYNX1G3V0Z9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LYNX1G3V0Z9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LYNX1G3V0Z9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYNX1G3V0Z9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYNX1G3V0Z9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYNX1G3V0Z9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LYNX1G3V0Z9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYNX1G3V0Z9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYNX1G3V0Z9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYNX1G3V0Z9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNX1G3V0Z9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms