Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HHLA1C9JL84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HHLA1C9JL84 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HHLA1C9JL84 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HHLA1C9JL84 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HHLA1C9JL84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HHLA1C9JL84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HHLA1C9JL84 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HHLA1C9JL84 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HHLA1C9JL84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHLA1C9JL84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HHLA1C9JL84 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HHLA1C9JL84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HHLA1C9JL84 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HHLA1C9JL84 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HHLA1C9JL84 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HHLA1C9JL84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HHLA1C9JL84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HHLA1C9JL84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HHLA1C9JL84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms