Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMAD1C9J7I0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMAD1C9J7I0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UMAD1C9J7I0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UMAD1C9J7I0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UMAD1C9J7I0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UMAD1C9J7I0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UMAD1C9J7I0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UMAD1C9J7I0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UMAD1C9J7I0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UMAD1C9J7I0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UMAD1C9J7I0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms