Protein–RNA interactions for Protein: A6NNJ1

FAM90A9P, Putative protein FAM90A9P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A9PA6NNJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM90A9PA6NNJ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM90A9PA6NNJ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM90A9PA6NNJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A9PA6NNJ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM90A9PA6NNJ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM90A9PA6NNJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM90A9PA6NNJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM90A9PA6NNJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM90A9PA6NNJ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM90A9PA6NNJ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A9PA6NNJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A9PA6NNJ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM90A9PA6NNJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms