Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP69A5D8W1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP69A5D8W1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP69A5D8W1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP69A5D8W1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP69A5D8W1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP69A5D8W1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP69A5D8W1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP69A5D8W1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP69A5D8W1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP69A5D8W1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms