Protein–RNA interactions for Protein: A2PYH4

HFM1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFM1A2PYH4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HFM1A2PYH4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
HFM1A2PYH4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
HFM1A2PYH4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
HFM1A2PYH4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
HFM1A2PYH4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
HFM1A2PYH4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
HFM1A2PYH4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
HFM1A2PYH4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
HFM1A2PYH4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
HFM1A2PYH4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
HFM1A2PYH4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
HFM1A2PYH4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
HFM1A2PYH4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
HFM1A2PYH4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
HFM1A2PYH4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
HFM1A2PYH4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HFM1A2PYH4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
HFM1A2PYH4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
HFM1A2PYH4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
HFM1A2PYH4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
HFM1A2PYH4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
HFM1A2PYH4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
HFM1A2PYH4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
HFM1A2PYH4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
HFM1A2PYH4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
HFM1A2PYH4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
HFM1A2PYH4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HFM1A2PYH4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
HFM1A2PYH4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HFM1A2PYH4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HFM1A2PYH4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
HFM1A2PYH4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
HFM1A2PYH4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
HFM1A2PYH4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
HFM1A2PYH4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
HFM1A2PYH4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
HFM1A2PYH4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
HFM1A2PYH4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HFM1A2PYH4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms