Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRV1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRV1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1W2PRV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1W2PRV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1W2PRV1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1W2PRV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PRV1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1W2PRV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PRV1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PRV1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PRV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PRV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms