Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PRF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PRF3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PRF3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PRF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1W2PRF3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1W2PRF3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PRF3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A1W2PRF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PRF3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms