Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3HER8

GOLGA6L10, Golgin subfamily A member 6-like protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6L10A0A0M3HER8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L10A0A0M3HER8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLGA6L10A0A0M3HER8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6L10A0A0M3HER8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6L10A0A0M3HER8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6L10A0A0M3HER8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA6L10A0A0M3HER8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GOLGA6L10A0A0M3HER8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms