Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAV9-2A0A087WT02 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAV9-2A0A087WT02 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAV9-2A0A087WT02 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAV9-2A0A087WT02 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAV9-2A0A087WT02 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAV9-2A0A087WT02 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAV9-2A0A087WT02 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAV9-2A0A087WT02 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAV9-2A0A087WT02 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAV9-2A0A087WT02 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAV9-2A0A087WT02 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAV9-2A0A087WT02 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAV9-2A0A087WT02 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAV9-2A0A087WT02 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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