Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARID3CA6NKF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARID3CA6NKF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARID3CA6NKF2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1123.8 ms