RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413035.5

IPO9-AS1-201, IPO9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene IPO9-AS1, Length 839 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.13■■■■■ 6.1
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.08■■■■■ 5.13
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ABCC9O60706 1549 aa45.58■■■■■ 4.89
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NACADO15069 1562 aa44.11■■■■■ 4.65
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.07■■■■■ 4.65
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.05■■■■■ 4.64
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MYO15BQ96JP2 1530 aa44■■■■■ 4.63
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
IPO9-AS1-201ENST00000413035 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.09■■■■■ 4.49
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SCRIBQ14160 1630 aa43.01■■■■■ 4.48
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.72■■■■■ 4.43
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.6■■■■■ 4.41
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.32■■■■■ 4.37
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.34■■■■■ 4.21
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.3■■■■■ 4.2
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.26■■■■■ 4.2
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SMARCA4P51532 1647 aa41.17■■■■■ 4.18
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.97■■■■■ 4.15
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.79■■■■■ 4.12
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SMARCA2P51531 1590 aa40.78■■■■■ 4.12
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.75■■■■■ 4.11
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NCAPD3P42695 1498 aa40.66■■■■■ 4.1
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
IPO9-AS1-201ENST00000413035 HMGXB3Q12766 1538 aa40.58■■■■■ 4.09
IPO9-AS1-201ENST00000413035 WIZO95785 1651 aa40.56■■■■■ 4.08
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.65■■■■□ 3.94
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NESP48681 1621 aa39.58■■■■□ 3.93
IPO9-AS1-201ENST00000413035 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.56■■■■□ 3.92
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.49■■■■□ 3.91
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CFTRP13569 1480 aa39.39■■■■□ 3.9
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ERCC6Q03468 1493 aa39.25■■■■□ 3.87
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PRDM2Q13029 1718 aa39.2■■■■□ 3.87
IPO9-AS1-201ENST00000413035 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.17■■■■□ 3.86
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.09■■■■□ 3.85
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.02■■■■□ 3.84
IPO9-AS1-201ENST00000413035 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.86■■■■□ 3.81
IPO9-AS1-201ENST00000413035 WDR62O43379 1518 aa38.73■■■■□ 3.79
IPO9-AS1-201ENST00000413035 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CUX2O14529 1486 aa38.66■■■■□ 3.78
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.55■■■■□ 3.76
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TOPBP1Q92547 1522 aa38.53■■■■□ 3.76
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ABCC8Q09428 1581 aa38.49■■■■□ 3.75
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CUX1P39880 1505 aa38.43■■■■□ 3.74
IPO9-AS1-201ENST00000413035 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.32■■■■□ 3.73
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SYNJ1O43426 1573 aa38.26■■■■□ 3.72
IPO9-AS1-201ENST00000413035 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
IPO9-AS1-201ENST00000413035 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.23■■■■□ 3.71
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TOP2BQ02880 1626 aa38.22■■■■□ 3.71
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.22■■■■□ 3.71
IPO9-AS1-201ENST00000413035 IFT140Q96RY7 1462 aa38.15■■■■□ 3.7
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.04■■■■□ 3.68
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SOGA1O94964 1423 aa38.03■■■■□ 3.68
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
IPO9-AS1-201ENST00000413035 WDR97A6NE52 1622 aa37.94■■■■□ 3.66
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.86■■■■□ 3.65
IPO9-AS1-201ENST00000413035 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.76■■■■□ 3.63
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.72■■■■□ 3.63
IPO9-AS1-201ENST00000413035 TRIM41Q8WV44 630 aa37.65■■■■□ 3.62
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.63■■■■□ 3.61
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PBRM1Q86U86 1689 aa37.59■■■■□ 3.61
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GRIN2BQ13224 1484 aa37.57■■■■□ 3.6
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.51■■■■□ 3.6
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.49■■■■□ 3.59
IPO9-AS1-201ENST00000413035 KIF27Q86VH2 1401 aa37.47■■■■□ 3.59
IPO9-AS1-201ENST00000413035 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.41■■■■□ 3.58
IPO9-AS1-201ENST00000413035 ADAMTS12P58397 1594 aa37.34■■■■□ 3.57
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CHD1O14646 1710 aa37.29■■■■□ 3.56
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.28■■■■□ 3.56
IPO9-AS1-201ENST00000413035 SYNJ2O15056 1496 aa37.27■■■■□ 3.56
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.21■■■■□ 3.55
IPO9-AS1-201ENST00000413035 IGF1RP08069 1367 aa37.21■■■■□ 3.55
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CUL7Q14999 1698 aa37.2■■■■□ 3.55
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FBLN2P98095 1184 aa37.16■■■■□ 3.54
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
IPO9-AS1-201ENST00000413035 GRIN2AQ12879 1464 aa37.11■■■■□ 3.53
IPO9-AS1-201ENST00000413035 EEA1Q15075 1411 aa37.07■■■■□ 3.52
IPO9-AS1-201ENST00000413035 OSCARQ8IYS5 282 aa37.03■■■■□ 3.52
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.03■■■■□ 3.52
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CEP170Q5SW79 1584 aa36.92■■■■□ 3.5
IPO9-AS1-201ENST00000413035 NUP160Q12769 1436 aa36.92■■■■□ 3.5
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.9■■■■□ 3.5
IPO9-AS1-201ENST00000413035 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
IPO9-AS1-201ENST00000413035 PRXQ9BXM0 1461 aa36.88■■■■□ 3.5
IPO9-AS1-201ENST00000413035 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
IPO9-AS1-201ENST00000413035 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.87■■■■□ 3.49
IPO9-AS1-201ENST00000413035 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.81■■■■□ 3.48
IPO9-AS1-201ENST00000413035 KIF21BO75037 1637 aa36.7■■■■□ 3.47
IPO9-AS1-201ENST00000413035 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms