RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.74■■■■■ 6.03
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VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.46■■■■■ 5.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.23■■■■■ 4.83
VIM-AS1-202ENST00000605833 NACADO15069 1562 aa44.84■■■■■ 4.77
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.82■■■■■ 4.77
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.57■■■■■ 4.73
VIM-AS1-202ENST00000605833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.35■■■■■ 4.69
VIM-AS1-202ENST00000605833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.3■■■■■ 4.68
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.1■■■■■ 4.65
VIM-AS1-202ENST00000605833 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.98■■■■■ 4.63
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.5■■■■■ 4.55
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCRIBQ14160 1630 aa43.31■■■■■ 4.52
VIM-AS1-202ENST00000605833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
VIM-AS1-202ENST00000605833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.04■■■■■ 4.48
VIM-AS1-202ENST00000605833 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.91■■■■■ 4.46
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
VIM-AS1-202ENST00000605833 NCAPD3P42695 1498 aa41.36■■■■■ 4.21
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.26■■■■■ 4.2
VIM-AS1-202ENST00000605833 SMARCA4P51532 1647 aa41.24■■■■■ 4.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.22■■■■■ 4.19
VIM-AS1-202ENST00000605833 SMARCA2P51531 1590 aa41.14■■■■■ 4.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 ERCC6Q03468 1493 aa41.14■■■■■ 4.18
VIM-AS1-202ENST00000605833 HMGXB3Q12766 1538 aa41.11■■■■■ 4.17
VIM-AS1-202ENST00000605833 CUX2O14529 1486 aa41.08■■■■■ 4.17
VIM-AS1-202ENST00000605833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
VIM-AS1-202ENST00000605833 NESP48681 1621 aa40.91■■■■■ 4.14
VIM-AS1-202ENST00000605833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
VIM-AS1-202ENST00000605833 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.78■■■■■ 4.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.68■■■■■ 4.1
VIM-AS1-202ENST00000605833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.52■■■■■ 4.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.43■■■■■ 4.06
VIM-AS1-202ENST00000605833 WIZO95785 1651 aa40.24■■■■■ 4.03
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.24■■■■■ 4.03
VIM-AS1-202ENST00000605833 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.1■■■■■ 4.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.97■■■■□ 3.99
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR62O43379 1518 aa39.9■■■■□ 3.98
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.78■■■■□ 3.96
VIM-AS1-202ENST00000605833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.71■■■■□ 3.95
VIM-AS1-202ENST00000605833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
VIM-AS1-202ENST00000605833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
VIM-AS1-202ENST00000605833 CFTRP13569 1480 aa39.63■■■■□ 3.94
VIM-AS1-202ENST00000605833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM41Q8WV44 630 aa39.43■■■■□ 3.9
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRDM2Q13029 1718 aa39.36■■■■□ 3.89
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.17■■■■□ 3.86
VIM-AS1-202ENST00000605833 OSCARQ8IYS5 282 aa39.1■■■■□ 3.85
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
VIM-AS1-202ENST00000605833 IFT140Q96RY7 1462 aa38.96■■■■□ 3.83
VIM-AS1-202ENST00000605833 TOPBP1Q92547 1522 aa38.95■■■■□ 3.83
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.81■■■■□ 3.8
VIM-AS1-202ENST00000605833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
VIM-AS1-202ENST00000605833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
VIM-AS1-202ENST00000605833 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCC8Q09428 1581 aa38.75■■■■□ 3.79
VIM-AS1-202ENST00000605833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGEF11O15085 1522 aa38.61■■■■□ 3.77
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHD1O14646 1710 aa38.59■■■■□ 3.77
VIM-AS1-202ENST00000605833 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.57■■■■□ 3.76
VIM-AS1-202ENST00000605833 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.43■■■■□ 3.74
VIM-AS1-202ENST00000605833 FBLN2P98095 1184 aa38.33■■■■□ 3.73
VIM-AS1-202ENST00000605833 SOGA1O94964 1423 aa38.3■■■■□ 3.72
VIM-AS1-202ENST00000605833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.29■■■■□ 3.72
VIM-AS1-202ENST00000605833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.25■■■■□ 3.71
VIM-AS1-202ENST00000605833 CUX1P39880 1505 aa38.24■■■■□ 3.71
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARAP1Q96P48 1450 aa38.22■■■■□ 3.71
VIM-AS1-202ENST00000605833 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.21■■■■□ 3.71
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR97A6NE52 1622 aa38.17■■■■□ 3.7
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.07■■■■□ 3.68
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
VIM-AS1-202ENST00000605833 GRIN2BQ13224 1484 aa38.02■■■■□ 3.68
VIM-AS1-202ENST00000605833 SYNJ1O43426 1573 aa38■■■■□ 3.67
VIM-AS1-202ENST00000605833 PBRM1Q86U86 1689 aa37.99■■■■□ 3.67
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
VIM-AS1-202ENST00000605833 SYNJ2O15056 1496 aa37.93■■■■□ 3.66
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
VIM-AS1-202ENST00000605833 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.87■■■■□ 3.65
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.83■■■■□ 3.65
VIM-AS1-202ENST00000605833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
VIM-AS1-202ENST00000605833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.8■■■■□ 3.64
VIM-AS1-202ENST00000605833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.59■■■■□ 3.61
VIM-AS1-202ENST00000605833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAMTS12P58397 1594 aa37.58■■■■□ 3.61
VIM-AS1-202ENST00000605833 TOP2BQ02880 1626 aa37.56■■■■□ 3.6
VIM-AS1-202ENST00000605833 GRIN2AQ12879 1464 aa37.56■■■■□ 3.6
VIM-AS1-202ENST00000605833 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.51■■■■□ 3.6
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEP170Q5SW79 1584 aa37.49■■■■□ 3.59
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUP160Q12769 1436 aa37.42■■■■□ 3.58
VIM-AS1-202ENST00000605833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.36■■■■□ 3.57
VIM-AS1-202ENST00000605833 SHROOM2Q13796 1616 aa37.32■■■■□ 3.57
VIM-AS1-202ENST00000605833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.32■■■■□ 3.57
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
VIM-AS1-202ENST00000605833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.06■■■■□ 3.52
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.99■■■■□ 3.51
VIM-AS1-202ENST00000605833 JPH4Q96JJ6 628 aa36.96■■■■□ 3.51
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