RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298466.9

SOHLH1-201, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-201ENST00000298466 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.84■■■■■ 6.05
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.55■■■■■ 5.04
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCC9O60706 1549 aa45.28■■■■■ 4.84
SOHLH1-201ENST00000298466 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.18■■■■■ 4.66
SOHLH1-201ENST00000298466 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
SOHLH1-201ENST00000298466 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
SOHLH1-201ENST00000298466 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.63■■■■■ 4.57
SOHLH1-201ENST00000298466 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.62■■■■■ 4.57
SOHLH1-201ENST00000298466 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.57■■■■■ 4.57
SOHLH1-201ENST00000298466 SCRIBQ14160 1630 aa42.74■■■■■ 4.43
SOHLH1-201ENST00000298466 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.67■■■■■ 4.42
SOHLH1-201ENST00000298466 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
SOHLH1-201ENST00000298466 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.37■■■■■ 4.37
SOHLH1-201ENST00000298466 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
SOHLH1-201ENST00000298466 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.22■■■■■ 4.19
SOHLH1-201ENST00000298466 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SOHLH1-201ENST00000298466 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.16■■■■■ 4.18
SOHLH1-201ENST00000298466 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.9■■■■■ 4.14
SOHLH1-201ENST00000298466 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SOHLH1-201ENST00000298466 SMARCA4P51532 1647 aa40.85■■■■■ 4.13
SOHLH1-201ENST00000298466 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.8■■■■■ 4.12
SOHLH1-201ENST00000298466 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
SOHLH1-201ENST00000298466 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.54■■■■■ 4.08
SOHLH1-201ENST00000298466 SMARCA2P51531 1590 aa40.42■■■■■ 4.06
SOHLH1-201ENST00000298466 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.39■■■■■ 4.06
SOHLH1-201ENST00000298466 NCAPD3P42695 1498 aa40.39■■■■■ 4.06
SOHLH1-201ENST00000298466 WIZO95785 1651 aa40.38■■■■■ 4.05
SOHLH1-201ENST00000298466 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
SOHLH1-201ENST00000298466 HMGXB3Q12766 1538 aa40.17■■■■■ 4.02
SOHLH1-201ENST00000298466 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
SOHLH1-201ENST00000298466 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
SOHLH1-201ENST00000298466 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.53■■■■□ 3.92
SOHLH1-201ENST00000298466 NESP48681 1621 aa39.38■■■■□ 3.89
SOHLH1-201ENST00000298466 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.29■■■■□ 3.88
SOHLH1-201ENST00000298466 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.17■■■■□ 3.86
SOHLH1-201ENST00000298466 CFTRP13569 1480 aa39.16■■■■□ 3.86
SOHLH1-201ENST00000298466 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.95■■■■□ 3.83
SOHLH1-201ENST00000298466 ERCC6Q03468 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
SOHLH1-201ENST00000298466 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.84■■■■□ 3.81
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.81■■■■□ 3.8
SOHLH1-201ENST00000298466 PRDM2Q13029 1718 aa38.73■■■■□ 3.79
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.7■■■■□ 3.79
SOHLH1-201ENST00000298466 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.51■■■■□ 3.76
SOHLH1-201ENST00000298466 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.75
SOHLH1-201ENST00000298466 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
SOHLH1-201ENST00000298466 WDR62O43379 1518 aa38.34■■■■□ 3.73
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCC8Q09428 1581 aa38.31■■■■□ 3.72
SOHLH1-201ENST00000298466 TOPBP1Q92547 1522 aa38.27■■■■□ 3.72
SOHLH1-201ENST00000298466 CUX1P39880 1505 aa38.22■■■■□ 3.71
SOHLH1-201ENST00000298466 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.21■■■■□ 3.71
SOHLH1-201ENST00000298466 CUX2O14529 1486 aa38.19■■■■□ 3.7
SOHLH1-201ENST00000298466 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.7
SOHLH1-201ENST00000298466 SYNJ1O43426 1573 aa38.07■■■■□ 3.68
SOHLH1-201ENST00000298466 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
SOHLH1-201ENST00000298466 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38■■■■□ 3.67
SOHLH1-201ENST00000298466 TOP2BQ02880 1626 aa37.98■■■■□ 3.67
SOHLH1-201ENST00000298466 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.92■■■■□ 3.66
SOHLH1-201ENST00000298466 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.91■■■■□ 3.66
SOHLH1-201ENST00000298466 SOGA1O94964 1423 aa37.87■■■■□ 3.65
SOHLH1-201ENST00000298466 IFT140Q96RY7 1462 aa37.83■■■■□ 3.65
SOHLH1-201ENST00000298466 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
SOHLH1-201ENST00000298466 TRIM41Q8WV44 630 aa37.78■■■■□ 3.64
SOHLH1-201ENST00000298466 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
SOHLH1-201ENST00000298466 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.72■■■■□ 3.63
SOHLH1-201ENST00000298466 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SOHLH1-201ENST00000298466 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.63■■■■□ 3.61
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.6■■■■□ 3.61
SOHLH1-201ENST00000298466 WDR97A6NE52 1622 aa37.54■■■■□ 3.6
SOHLH1-201ENST00000298466 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
SOHLH1-201ENST00000298466 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.42■■■■□ 3.58
SOHLH1-201ENST00000298466 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.38■■■■□ 3.57
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF27Q86VH2 1401 aa37.32■■■■□ 3.56
SOHLH1-201ENST00000298466 GRIN2BQ13224 1484 aa37.3■■■■□ 3.56
SOHLH1-201ENST00000298466 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.3■■■■□ 3.56
SOHLH1-201ENST00000298466 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.22■■■■□ 3.55
SOHLH1-201ENST00000298466 PBRM1Q86U86 1689 aa37.22■■■■□ 3.55
SOHLH1-201ENST00000298466 IGF1RP08069 1367 aa37.17■■■■□ 3.54
SOHLH1-201ENST00000298466 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.13■■■■□ 3.54
SOHLH1-201ENST00000298466 FBLN2P98095 1184 aa37.13■■■■□ 3.53
SOHLH1-201ENST00000298466 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SOHLH1-201ENST00000298466 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
SOHLH1-201ENST00000298466 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
SOHLH1-201ENST00000298466 SYNJ2O15056 1496 aa36.99■■■■□ 3.51
SOHLH1-201ENST00000298466 ADAMTS12P58397 1594 aa36.98■■■■□ 3.51
SOHLH1-201ENST00000298466 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.98■■■■□ 3.51
SOHLH1-201ENST00000298466 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.94■■■■□ 3.5
SOHLH1-201ENST00000298466 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.93■■■■□ 3.5
SOHLH1-201ENST00000298466 CHD1O14646 1710 aa36.92■■■■□ 3.5
SOHLH1-201ENST00000298466 EEA1Q15075 1411 aa36.9■■■■□ 3.5
SOHLH1-201ENST00000298466 CUL7Q14999 1698 aa36.87■■■■□ 3.49
SOHLH1-201ENST00000298466 OSCARQ8IYS5 282 aa36.86■■■■□ 3.49
SOHLH1-201ENST00000298466 GRIN2AQ12879 1464 aa36.84■■■■□ 3.49
SOHLH1-201ENST00000298466 PRXQ9BXM0 1461 aa36.76■■■■□ 3.47
SOHLH1-201ENST00000298466 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.74■■■■□ 3.47
SOHLH1-201ENST00000298466 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.68■■■■□ 3.46
SOHLH1-201ENST00000298466 CEP170Q5SW79 1584 aa36.65■■■■□ 3.46
SOHLH1-201ENST00000298466 NUP160Q12769 1436 aa36.64■■■■□ 3.46
SOHLH1-201ENST00000298466 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.52■■■■□ 3.44
SOHLH1-201ENST00000298466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.5■■■■□ 3.43
SOHLH1-201ENST00000298466 KIF21BO75037 1637 aa36.49■■■■□ 3.43
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