Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC53.26■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC53.26■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC53.26■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC53.25■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.24■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC53.24■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC53.24■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC53.22■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC53.22■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC53.21■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC53.21■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC53.21■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC53.21■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.2■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.2■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC53.19■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
NISCHQ9Y2I1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC53.18■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.18■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC53.17■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.16■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC53.13■■■■■ 6.1
NISCHQ9Y2I1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC53.12■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.1■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC53.09■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC53.07■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC53.07■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
NISCHQ9Y2I1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC53.07■■■■■ 6.09
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