RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.21■■■■■ 6.11
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.12■■■■■ 5.13
FAM53B-201ENST00000280780 ABCC9O60706 1549 aa46.19■■■■■ 4.99
FAM53B-201ENST00000280780 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.53■■■■■ 4.72
FAM53B-201ENST00000280780 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.33■■■■■ 4.69
FAM53B-201ENST00000280780 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.68
FAM53B-201ENST00000280780 NACADO15069 1562 aa44.31■■■■■ 4.68
FAM53B-201ENST00000280780 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.03■■■■■ 4.64
FAM53B-201ENST00000280780 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.93■■■■■ 4.62
FAM53B-201ENST00000280780 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
FAM53B-201ENST00000280780 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.29■■■■■ 4.52
FAM53B-201ENST00000280780 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.15■■■■■ 4.5
FAM53B-201ENST00000280780 SCRIBQ14160 1630 aa43.15■■■■■ 4.5
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.49■■■■■ 4.39
FAM53B-201ENST00000280780 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM53B-201ENST00000280780 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
FAM53B-201ENST00000280780 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.75■■■■■ 4.27
FAM53B-201ENST00000280780 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
FAM53B-201ENST00000280780 SMARCA4P51532 1647 aa41.24■■■■■ 4.19
FAM53B-201ENST00000280780 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
FAM53B-201ENST00000280780 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.08■■■■■ 4.17
FAM53B-201ENST00000280780 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.03■■■■■ 4.16
FAM53B-201ENST00000280780 NCAPD3P42695 1498 aa40.95■■■■■ 4.15
FAM53B-201ENST00000280780 SMARCA2P51531 1590 aa40.87■■■■■ 4.13
FAM53B-201ENST00000280780 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.8■■■■■ 4.12
FAM53B-201ENST00000280780 HMGXB3Q12766 1538 aa40.68■■■■■ 4.1
FAM53B-201ENST00000280780 WIZO95785 1651 aa40.65■■■■■ 4.1
FAM53B-201ENST00000280780 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.1
FAM53B-201ENST00000280780 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
FAM53B-201ENST00000280780 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
FAM53B-201ENST00000280780 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
FAM53B-201ENST00000280780 NESP48681 1621 aa40.07■■■■■ 4
FAM53B-201ENST00000280780 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.79■■■■□ 3.96
FAM53B-201ENST00000280780 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM53B-201ENST00000280780 ERCC6Q03468 1493 aa39.69■■■■□ 3.94
FAM53B-201ENST00000280780 CFTRP13569 1480 aa39.56■■■■□ 3.92
FAM53B-201ENST00000280780 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.53■■■■□ 3.92
FAM53B-201ENST00000280780 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.51■■■■□ 3.92
FAM53B-201ENST00000280780 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
FAM53B-201ENST00000280780 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.31■■■■□ 3.88
FAM53B-201ENST00000280780 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.21■■■■□ 3.87
FAM53B-201ENST00000280780 CUX2O14529 1486 aa39.19■■■■□ 3.86
FAM53B-201ENST00000280780 PRDM2Q13029 1718 aa39.19■■■■□ 3.86
FAM53B-201ENST00000280780 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.13■■■■□ 3.85
FAM53B-201ENST00000280780 WDR62O43379 1518 aa39■■■■□ 3.83
FAM53B-201ENST00000280780 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
FAM53B-201ENST00000280780 TOPBP1Q92547 1522 aa38.71■■■■□ 3.79
FAM53B-201ENST00000280780 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.62■■■■□ 3.77
FAM53B-201ENST00000280780 ABCC8Q09428 1581 aa38.59■■■■□ 3.77
FAM53B-201ENST00000280780 CUX1P39880 1505 aa38.5■■■■□ 3.75
FAM53B-201ENST00000280780 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
FAM53B-201ENST00000280780 IFT140Q96RY7 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
FAM53B-201ENST00000280780 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.32■■■■□ 3.72
FAM53B-201ENST00000280780 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.32■■■■□ 3.72
FAM53B-201ENST00000280780 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
FAM53B-201ENST00000280780 SOGA1O94964 1423 aa38.25■■■■□ 3.71
FAM53B-201ENST00000280780 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.719e-6■■■■■ 50.1
FAM53B-201ENST00000280780 SYNJ1O43426 1573 aa38.2■■■■□ 3.71
FAM53B-201ENST00000280780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.14■■■■□ 3.7
FAM53B-201ENST00000280780 TOP2BQ02880 1626 aa38.14■■■■□ 3.7
FAM53B-201ENST00000280780 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.12■■■■□ 3.69
FAM53B-201ENST00000280780 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
FAM53B-201ENST00000280780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.02■■■■□ 3.68
FAM53B-201ENST00000280780 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.01■■■■□ 3.67
FAM53B-201ENST00000280780 WDR97A6NE52 1622 aa37.97■■■■□ 3.67
FAM53B-201ENST00000280780 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.92■■■■□ 3.66
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM41Q8WV44 630 aa37.79■■■■□ 3.64
FAM53B-201ENST00000280780 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.78■■■■□ 3.64
FAM53B-201ENST00000280780 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.76■■■■□ 3.64
FAM53B-201ENST00000280780 GRIN2BQ13224 1484 aa37.72■■■■□ 3.63
FAM53B-201ENST00000280780 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.71■■■■□ 3.63
FAM53B-201ENST00000280780 OSCARQ8IYS5 282 aa37.69■■■■□ 3.62
FAM53B-201ENST00000280780 PBRM1Q86U86 1689 aa37.68■■■■□ 3.62
FAM53B-201ENST00000280780 FBLN2P98095 1184 aa37.64■■■■□ 3.62
FAM53B-201ENST00000280780 CHD1O14646 1710 aa37.61■■■■□ 3.61
FAM53B-201ENST00000280780 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
FAM53B-201ENST00000280780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
FAM53B-201ENST00000280780 SYNJ2O15056 1496 aa37.47■■■■□ 3.59
FAM53B-201ENST00000280780 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.43■■■■□ 3.58
FAM53B-201ENST00000280780 KIF27Q86VH2 1401 aa37.39■■■■□ 3.58
FAM53B-201ENST00000280780 ADAMTS12P58397 1594 aa37.37■■■■□ 3.57
FAM53B-201ENST00000280780 IGF1RP08069 1367 aa37.36■■■■□ 3.57
FAM53B-201ENST00000280780 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.32■■■■□ 3.56
FAM53B-201ENST00000280780 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.32■■■■□ 3.56
FAM53B-201ENST00000280780 GRIN2AQ12879 1464 aa37.26■■■■□ 3.56
FAM53B-201ENST00000280780 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.19■■■■□ 3.54
FAM53B-201ENST00000280780 CEP170Q5SW79 1584 aa37.13■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 NUP160Q12769 1436 aa37.1■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.09■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.08■■■■□ 3.53
FAM53B-201ENST00000280780 CUL7Q14999 1698 aa37.07■■■■□ 3.52
FAM53B-201ENST00000280780 EEA1Q15075 1411 aa37.07■■■■□ 3.52
FAM53B-201ENST00000280780 ARHGEF11O15085 1522 aa37.07■■■■□ 3.52
FAM53B-201ENST00000280780 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
FAM53B-201ENST00000280780 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms