Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC93Q567U6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC93Q567U6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms