RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.36■■■■■ 6.13
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.77■■■■■ 5.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC9O60706 1549 aa45.37■■■■■ 4.85
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.64■■■■■ 4.74
TSNARE1-208ENST00000524325 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
TSNARE1-208ENST00000524325 NACADO15069 1562 aa43.87■■■■■ 4.61
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.79■■■■■ 4.6
TSNARE1-208ENST00000524325 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.73■■■■■ 4.59
TSNARE1-208ENST00000524325 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.13■■■■■ 4.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SCRIBQ14160 1630 aa43.11■■■■■ 4.49
TSNARE1-208ENST00000524325 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.73■■■■■ 4.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.72■■■■■ 4.43
TSNARE1-208ENST00000524325 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.49■■■■■ 4.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
TSNARE1-208ENST00000524325 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.25■■■■■ 4.19
TSNARE1-208ENST00000524325 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCA4P51532 1647 aa41.17■■■■■ 4.18
TSNARE1-208ENST00000524325 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.99■■■■■ 4.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.92■■■■■ 4.14
TSNARE1-208ENST00000524325 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.12
TSNARE1-208ENST00000524325 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.8■■■■■ 4.12
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCA2P51531 1590 aa40.65■■■■■ 4.1
TSNARE1-208ENST00000524325 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.64■■■■■ 4.1
TSNARE1-208ENST00000524325 NCAPD3P42695 1498 aa40.57■■■■■ 4.08
TSNARE1-208ENST00000524325 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGXB3Q12766 1538 aa40.35■■■■■ 4.05
TSNARE1-208ENST00000524325 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.99■■■■□ 3.99
TSNARE1-208ENST00000524325 NESP48681 1621 aa39.54■■■■□ 3.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.52■■■■□ 3.92
TSNARE1-208ENST00000524325 CFTRP13569 1480 aa39.43■■■■□ 3.9
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.26■■■■□ 3.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.08■■■■□ 3.85
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.07■■■■□ 3.85
TSNARE1-208ENST00000524325 ERCC6Q03468 1493 aa38.95■■■■□ 3.83
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM2Q13029 1718 aa38.91■■■■□ 3.82
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.89■■■■□ 3.82
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.88■■■■□ 3.82
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC8Q09428 1581 aa38.88■■■■□ 3.81
TSNARE1-208ENST00000524325 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.71■■■■□ 3.79
TSNARE1-208ENST00000524325 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
TSNARE1-208ENST00000524325 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
TSNARE1-208ENST00000524325 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.63■■■■□ 3.77
TSNARE1-208ENST00000524325 CUX1P39880 1505 aa38.62■■■■□ 3.77
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM41Q8WV44 630 aa38.56■■■■□ 3.76
TSNARE1-208ENST00000524325 SYNJ1O43426 1573 aa38.56■■■■□ 3.76
TSNARE1-208ENST00000524325 TOPBP1Q92547 1522 aa38.53■■■■□ 3.76
TSNARE1-208ENST00000524325 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.75
TSNARE1-208ENST00000524325 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.46■■■■□ 3.75
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR62O43379 1518 aa38.42■■■■□ 3.74
TSNARE1-208ENST00000524325 TOP2BQ02880 1626 aa38.39■■■■□ 3.74
TSNARE1-208ENST00000524325 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.34■■■■□ 3.73
TSNARE1-208ENST00000524325 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.32■■■■□ 3.72
TSNARE1-208ENST00000524325 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.24■■■■□ 3.71
TSNARE1-208ENST00000524325 CUX2O14529 1486 aa38.19■■■■□ 3.7
TSNARE1-208ENST00000524325 SOGA1O94964 1423 aa38.19■■■■□ 3.7
TSNARE1-208ENST00000524325 IFT140Q96RY7 1462 aa38■■■■□ 3.67
TSNARE1-208ENST00000524325 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
TSNARE1-208ENST00000524325 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
TSNARE1-208ENST00000524325 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.93■■■■□ 3.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.92■■■■□ 3.66
TSNARE1-208ENST00000524325 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.657e-7■□□□□ 11.3
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF27Q86VH2 1401 aa37.78■■■■□ 3.64
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR97A6NE52 1622 aa37.78■■■■□ 3.64
TSNARE1-208ENST00000524325 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.72■■■■□ 3.63
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.64■■■■□ 3.62
TSNARE1-208ENST00000524325 IGF1RP08069 1367 aa37.62■■■■□ 3.61
TSNARE1-208ENST00000524325 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.6■■■■□ 3.61
TSNARE1-208ENST00000524325 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.57■■■■□ 3.6
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIN2BQ13224 1484 aa37.54■■■■□ 3.6
TSNARE1-208ENST00000524325 EEA1Q15075 1411 aa37.53■■■■□ 3.6
TSNARE1-208ENST00000524325 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.45■■■■□ 3.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.43■■■■□ 3.58
TSNARE1-208ENST00000524325 PBRM1Q86U86 1689 aa37.42■■■■□ 3.58
TSNARE1-208ENST00000524325 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.4■■■■□ 3.58
TSNARE1-208ENST00000524325 FBLN2P98095 1184 aa37.35■■■■□ 3.57
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.31■■■■□ 3.56
TSNARE1-208ENST00000524325 PRXQ9BXM0 1461 aa37.29■■■■□ 3.56
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
TSNARE1-208ENST00000524325 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.27■■■■□ 3.56
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS12P58397 1594 aa37.25■■■■□ 3.55
TSNARE1-208ENST00000524325 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.24■■■■□ 3.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CUL7Q14999 1698 aa37.19■■■■□ 3.54
TSNARE1-208ENST00000524325 SYNJ2O15056 1496 aa37.18■■■■□ 3.54
TSNARE1-208ENST00000524325 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF21BO75037 1637 aa37.09■■■■□ 3.53
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIN2AQ12879 1464 aa37.08■■■■□ 3.53
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA3Q08378 1498 aa37.05■■■■□ 3.52
TSNARE1-208ENST00000524325 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
TSNARE1-208ENST00000524325 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP170Q5SW79 1584 aa36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms