RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623117.1

GTSE1-AS1-202, humanhuman

BASIC

Gene GTSE1-AS1, Length 1,518 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.66■■■■■ 6.18
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.45■■■■■ 5.19
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ABCC9O60706 1549 aa46.14■■■■■ 4.98
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.65■■■■■ 4.74
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NACADO15069 1562 aa44.55■■■■■ 4.72
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.48■■■■■ 4.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.44■■■■■ 4.7
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.39■■■■■ 4.7
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.53■■■■■ 4.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SCRIBQ14160 1630 aa43.36■■■■■ 4.53
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.23■■■■■ 4.51
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.22■■■■■ 4.51
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.69■■■■■ 4.42
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.15■■■■■ 4.34
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.74■■■■■ 4.27
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SMARCA4P51532 1647 aa41.52■■■■■ 4.24
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.39■■■■■ 4.22
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.24■■■■■ 4.19
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NCAPD3P42695 1498 aa41.17■■■■■ 4.18
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SMARCA2P51531 1590 aa41.14■■■■■ 4.18
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.14■■■■■ 4.18
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 HMGXB3Q12766 1538 aa40.94■■■■■ 4.14
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 WIZO95785 1651 aa40.93■■■■■ 4.14
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NESP48681 1621 aa40.08■■■■■ 4.01
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.07■■■■■ 4
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.98■■■■□ 3.99
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.95■■■■□ 3.99
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CFTRP13569 1480 aa39.83■■■■□ 3.97
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.67■■■■□ 3.94
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ERCC6Q03468 1493 aa39.65■■■■□ 3.94
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.54■■■■□ 3.92
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.5■■■■□ 3.91
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PRDM2Q13029 1718 aa39.44■■■■□ 3.9
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.37■■■■□ 3.89
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.25■■■■□ 3.87
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CUX2O14529 1486 aa39.13■■■■□ 3.85
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 WDR62O43379 1518 aa39.12■■■■□ 3.85
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TOPBP1Q92547 1522 aa38.92■■■■□ 3.82
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ABCC8Q09428 1581 aa38.88■■■■□ 3.81
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.87■■■■□ 3.81
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CUX1P39880 1505 aa38.79■■■■□ 3.8
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.65■■■■□ 3.78
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.57■■■■□ 3.77
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SYNJ1O43426 1573 aa38.56■■■■□ 3.76
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 IFT140Q96RY7 1462 aa38.54■■■■□ 3.76
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TOP2BQ02880 1626 aa38.52■■■■□ 3.76
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.49■■■■□ 3.75
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.48■■■■□ 3.75
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SOGA1O94964 1423 aa38.47■■■■□ 3.75
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.22■■■■□ 3.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 WDR97A6NE52 1622 aa38.21■■■■□ 3.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.01■■■■□ 3.68
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.01■■■■□ 3.67
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TRIM41Q8WV44 630 aa38■■■■□ 3.67
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRIN2BQ13224 1484 aa37.93■■■■□ 3.66
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.87■■■■□ 3.65
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PBRM1Q86U86 1689 aa37.85■■■■□ 3.65
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.84■■■■□ 3.65
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 KIF27Q86VH2 1401 aa37.79■■■■□ 3.64
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.74■■■■□ 3.63
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 IGF1RP08069 1367 aa37.69■■■■□ 3.62
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.68■■■■□ 3.62
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SYNJ2O15056 1496 aa37.65■■■■□ 3.62
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CHD1O14646 1710 aa37.64■■■■□ 3.62
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FBLN2P98095 1184 aa37.64■■■■□ 3.62
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 OSCARQ8IYS5 282 aa37.62■■■■□ 3.61
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ADAMTS12P58397 1594 aa37.61■■■■□ 3.61
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.58■■■■□ 3.61
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.57■■■■□ 3.61
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRIN2AQ12879 1464 aa37.46■■■■□ 3.59
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CUL7Q14999 1698 aa37.43■■■■□ 3.58
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.41■■■■□ 3.58
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NUP160Q12769 1436 aa37.31■■■■□ 3.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 EEA1Q15075 1411 aa37.3■■■■□ 3.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.29■■■■□ 3.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CEP170Q5SW79 1584 aa37.28■■■■□ 3.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.27■■■■□ 3.56
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PRXQ9BXM0 1461 aa37.23■■■■□ 3.55
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.21■■■■□ 3.55
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.03■■■■□ 3.52
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ARHGEF11O15085 1522 aa37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms