Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTCH1Q13635 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTCH1Q13635 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
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