Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00271P0C7V0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00271P0C7V0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00271P0C7V0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms